在第九届中国花卉博览会上，牡丹区企业生产的牡丹籽油、牡丹茶、牡丹食品、牡丹日化用品、牡丹不凋花5大类30余种牡丹产品参展，囊括了牡丹深加工类产品展赛中的悉数5项金奖，充分展示了牡丹区牡丹产业发展领先地位和科研成果。康普生物科技有限公司生产的牡丹籽油更是获得了第九届中国花卉博览会特色花卉主题展牡丹芍药展区牡丹加工产品类唯一金奖。

并且，麟源牡丹更是德国兰之馨、美国雅诗兰黛的纯油供给商，这说明以牡丹籽油为代表的系列牡丹产品已开始在国际舞台上崭露锋芒。目前，牡丹产品已遍及全国各个省份、大中城市和重要电商平台。

随着牡丹产业化发展进程的加快，在传统的牡丹观赏之外，牡丹资源的深度开发渐入佳境。目前，牡丹区拥有各类牡丹加工生产企业100余家，先后与10多家国内外高等院校、科研院所建立了长期合作关系，成立了中国牡丹应用研究所、中美牡丹生物科技研究院、油用牡丹工程技术研究中间、中科院菏泽牡丹院士工作站等科研机构19家。

据中国牡丹芍药协会副会长、牡丹区原副区长张贵宾介绍，目前，牡丹区有牡丹科研机构20余个，牡丹籽油深加工企业20多家，是2013年的10倍；产业链条进一步拉长，牡丹由曩昔单一的观赏、药用，渐渐向医药、食品、畜牧养殖等多个领域延长，形成了从牡丹莳植到牡丹深加工多元化的产业链条，走上了深条理、多领域的综合开发行使之路，牡丹区正着力把牡丹产业打造成千亿级特色支柱产业。

同时，牡丹区把新技术、新业态、新模式引入农业生产发展，实现产业链延长、价值链提拔、供给链贯通“三链重构”，推动农业“接二连三”发展，实现全环节升级、全链条增值，成功探索出了 “牡丹+中药材、牡丹+绿化苗木、牡丹+果树、牡丹+粮油作物”多种较为成熟的牡丹套种模式。

目前，牡丹种苗出口率占全国的80%以上，远销美国、荷兰、法国等20多个国家和地区，去年实现出口贩卖收入1600余万美元。“牡丹区每年销往全国各地的牡丹在200万棵以上。”牡丹商会会长吴勇华说，“菏泽牡丹占全国牡丹贩卖总量的九成左右。”